Resto’s Weblog

Hola a los lectores de mi blog. Como ya sabrán y si no saben aún, trabajo en la investigación del Dr. Martínez Cruzado: “El uso de ADN mitocondrial para descubrir migraciones pre-colombinas al Caribe: resultados para Puerto Rico y expectativas para Republica Dominicana”. Hasta el momento estuve trabajando con sobre 90 muestras de la región hipervariable 2 (especificidad de procedencia) de República Dominicana, que poco ha poco se han ido amplificando, secuenciando y leídas. Mi trabajo como colaboradora en la investigación del Dr. Cruzado, por el momento, es extracción de ADN de las muestras, amplificar (PCR), purificar y aun estoy aprendiendo a leer dichas secuencias.

El objetivo a largo plazo del proyecto es alcanzar un mejor entendimiento en las relaciones geneticas entre Indios de Puerto Rico e Hispaniola en tiempos pre-Hispanicos y construir la filogeografia africana de Republica Dominicana. Gracias a la oportunidad de participar en el programa BIOMINDS y el poder trabajar en el laboratorio con el Dr. Juan Martinez Cruzado durante este semestre me permitieron desarrollar mis conocimientos en mi area de estudio. Esta experiencia fortalecio mis destrezas, me expusieron a nuevos instrumentos de laboratorio desconocidos por mi antes y siempre tenia tiempo para ir al laboratorio. Planes futuros para mi es poder disenar un experimento, presentar la investigacion en reuniones o conferencias y me entusiasmo para seguir estudios graduados, como por ejemplo en genetica, microbiologia o biologia molecular. Este verano 2008 voy para Iowa State University a participar en un programa de investigacion o internado de “Molecular Biotechnology and genetics” el cual se que voy a disfrutar y sobre todo aprender mucho.

Buenos dias, tardes o noches….

La Biología Molecular es una ciencia cuyo objetivo fundamental es la comprensión de todos aquellos procesos celulares, que contribuyen a que la información genética se transmita eficientemente de unos seres a otros, y se exprese en los nuevos individuos. En la investigación del Dr. Martínez Cruzado sobre el uso del mtDNA para descubrir la procedencia del individuo he utilizado diferentes métodos y técnicas como por ejemplo PCR, el cual emplea una serie de procesos de calor para separar las bandas en la doble hélice de DNA; electroforesis donde separa las moléculas de DNA según tamaño molecular y carga eléctrica; purificación, en el que como dice la palabra se purifica, o sea, se le extraen los reactivos del PCR y se queda solo el DNA. También he aprendido a hacer la mezcla de reactivos para llevar a cabo los procedimientos de PCR, purificación, tinción del DNA en el gel con bromuro de etidio, el cual tiñe el DNA, y electroforesis, entre otros. Cada técnica y procedimiento debe hacerse de forma aséptica y cuidadosa para que el resultado sea efectivo. Los beneficios son los resultados obtenidos y avances en la ciencia y tecnología.

        Este semestre estoy haciendo servicio comunitario en el programa IAP en la comunidad de Añasco Playa junto a un grupo de estudiantes de la Universidad de Puerto Rico de Mayaguez. En el área científica, al mando del profesor Luis Ríos, junto con Namir Massini tenemos un plan de trabajo con la comunidad.

        Nuestro plan de trabajo principalmente es seleccionar varios hogares cerca del caño, donde podamos tomar muestras de pozos sépticos que “puedan” desembocar en el mismo y que posiblemente se conecte a la costa en diferentes partes de la playa de Añasco, debido a que a que posiblemente haya una contaminación con microorganismos de la especie de Enterococos en dicha playa. También se tomaran muestras en diferentes partes de la costa de la playa, para poder identificar si los microorganismos coinciden en ambos cuerpos de agua. Nuestro procedimiento será enumerar e identificar, en el laboratorio, la presencia de Enterococos en la comunidad de Añasco Playa.Tomaremos varias muestras de “agua contaminada” tanto del caño como de la playa. Debido a que el caño y la playa se encuentran separados por arena se tiene que excavar para encontrar flujo de agua que los conecte. Luego de esto se realizaran  diluciones con el sistema de Enterolert, en donde se tomaran 100ml de los 500ml iniciales  para poder determinar si en la muestra se encuentran Enterococos. Este método nos indica la presencia o ausencia de estos microorganismos, si el medio se torna fluorescente nos dice que hay presencia positiva de Enterococos. Luego se incubaran a 41˚C por un periodo de 24 horas.Otro método a utilizarse es el de diluciones en serie, donde podremos cuantificar de forma general los Enterococos,  luego de ver la densidad poblacional en general se utilizará el método de Most Probable Number ( MPN ) para cuantificar específicamente el numero de células en la muestra, aunque este medio no es especifico para la especie de Enterococos. Este medio contiene Azide Dextrose Broth, usado para cultivar estos microorganismos en agua con contaminación fecal. Los resultados se entregarán a los estudiantes de investigación del laboratorio del profesor Luis Ríos para la identificación del mismo. 

      In 1994 the doctor Juan Carlos Martínez Cruzador, professor of genetics of the department of Biology of the University Campus of Mayagüez (RUM), began in an unprecedented project.  His interest was to discover the origin of the native Taínos, first settlers of the Island.  He confessed that only knew what had taught him in their classes of History of Puerto Rico in fifth and twelfth grade.   He remembered that was the archaeologist Juan José Ortiz Aguilú, director of the Program of Archeology of the Institute of Puerto Rican Culture, who awoke their interest in this theme when in an occasion offered him to investigate the mitochondrial deoxyribonucleic acid (DNA) in an old skeleton.   “The mitochondrial DNA (mtDNA) is inherited from the mother.  The mitochondrion we have it all, but only the mothers inherit it”, explained the scientific doctorate in Harvard.  The enormous majority of our genetic material, the DNA, is found in the nucleus of the cell, nevertheless, the mitochondrial is not in the nucleus, but in an organelle known as mitochondrion.  This type of DNA is 200 thousand times smaller than the nuclear one and is obtained only from the mother.  In this way, remains intact generation through generation, maintaining its original identity.   “The human evolution ‘is written’ in the DNA mitochondrial”, uphold the professor, who assured that in spite of the intense crossbreeding in the region of the Caribbean there are mtsDNA that maintain their original identity and they can be identified as the Africans, native or Caucasian. 

       It was as well when the doctor Martínez Cruzado initiated his research on the native migrations to the Caribbean and with the aid of one of his students, he managed to extract the mitochondrial DNA from a sample of four bones.  “Based on the sequence it was determined that the DNA was of native origin”, he said.  Nevertheless, the four of them were identical as if they were brothers.  “That worried us because the idea was to distinguish some Indians of other and to try to find relation among different”, affirmed.  As he said, the genetic process to extract material of bones is very tedious and costly for which they desisted to work with that method. Other methods from extracting DNA are from hair, saliva, and blood. Ours is from saliva. For more information about Dr. Martinez Cruzado’s research click this link.

       Since I’m working in the laboratory everyone is very kind. The ones with more knowledge help those ones with less, there’s no need to be afraid of asking because it helps in the learning of the person. My collaboration in the research is the use of mitochondrial DNA to discover Pre-Columbian migrations to the Caribbean: results for Puerto Rico and expectations for the Dominican Republic. Methods or techniques used in this process are PCR,in which samples are amplified that have been demonstrated to be native origin with HVR-I,electroforesis, purification. I also have practiced auto clave. Due that this is my first time doing research and I do not know much information relevant to the reagents and everything, I have committed various errors, but from errors we learn and I’m learning a lot.